Devi usare i fogli di stile (css) per poter realizzare ciò che hai in mente, non pui continuare così
Devi iniziare a pensare in termini di contenitore di informazioni (x)html + css e informazione cioè il testo da inserire nel sito.
Se vuoi realizzare il sito che hai in mente devi mettere mano ai css e iniziare seriamente a studiare.
Dw va anche bene ma non usare l'impostazione wysiwyg ma guarda sempre la pagina da un browser (f12 o meglio ancora salva e poi carica la pagina in esterno), perchè è su un browser che alla fine vedrai la pagina.
Il layer devi posizionarlo dove vuoi tu, e non basta scrivere <div impostazioni varie> ma devi posizionarlo con precisione all'interno della pagina.
Ti sevirà un layer contenitore per l'intera pagina e quindi all'interno di esso i vari layer che contengono le varie sezioni, un po come si fa con le tabelle.
Oppure se pensi di riuscirci, posizionare un solo layer all'interno del tuo "spazio bianco" impostando la position: absolute; e poi muovendolo a forza di pixel (top: 12px; left: 12px) ovvio 12 pixel era solo un esempio. Solo che così ridimensionando la pagina rischi che ti sballa un po tutto.
Inizia a seguire qualche sito: www.constile.org tanto per iniziare perchè è semplice.