Ecco un caca-esempio di quello che cerchi...

codice:
define('FPDF_FONTPATH','font/');
require('fpdf.php');
$utente = "utente"; 
$password = "password";
$hostname = "host";
$nome_database = "database";
$nome_tabella = "tabella";
$nome_colonna = "colonna";

mysql_connect($hostname,$utente,$password);
mysql_select_db ($nome_database);

$query = mysql_query("SELECT * FROM $nome_tabella");
$pdf=new FPDF();
$pdf->AliasNbPages();
$pdf->AddPage();
$pdf->SetFont('Arial','',12);
while($risultato = mysql_fetch_array($query))
    {
    $pdf->Cell(100,8,$risultato[$nome_colonna],'0',0,'L');
    $pdf->Ln();
    }
$pdf->Output();
exit();