Vediamo un po' se ho capito bene...

da che ne so : 12345678,90
vorresti visualizzare : 12'345'678,90 ?

Semplice!

codice:
<asp:Label ID="Totale" Text='<%#
String.Format("{0:000,000.00}",DataBinder.Eval(Container.DataItem, "Totale")) %>'
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Prova e poi fammi sapere...