è molto semplice, quello che vuoi fare non puoi farlo ...

PHP è sul server, dunque non puoi seguire la progressione di uno script PHP tramite JS.

O ti accontenti di sapere che ha finito oppure devi far in modo di "monitorare" la progressione dell'invio dall'esterno, dunque il tuo script d'invio deve salvare lo stato da qualche parte (DB, file, ...)