Il fatto di usare flash è il motivo per cui puoi evitare di dover ricaricare tutto, almeno uno dei motivi principali.
L'azione che cerchi tu è un loadMovie ovvero poter caricare un swf esterno all'interno del tuo swf base (diciamo la home).

Mi sembra di capire però che tecnicamente ti mancano un bel po' di basi, per questo prima ti consiglio di farti un po' di tutorial e guide (ad esempio quelle su www.flash-mx.it) per principianti.
Poi se hai problemi su qualcosa di specifico chiedi pure qui!!!