dovresti provare queste tre soluzioni.

getURL("javascript:apriFinestra('pagina.html','fla shPopup', 'width=640,height=480,status=yes' )");




window.open('pagina.html','flashPopup', 'width=640,height=480,status=yes' );



on (release) {
popup('pagina.html', 'titolo', 550, 500, 250, 50, 'scrollbars=yes','status=yes');
}

naturalmente dando un valore più grande alla finestra ti rimane sempre centrata e ai bordi dello schermo, qualunque sia la risoluzione.