Ciao, mettendo da parte la programmazione, ho visto che EmEditor, come altri editor, ha già una sua funzione di ricerca e sostituzione avanzata, menu "Cerca > Sostituire negli archivi...".
Con quello strumento puoi effettuare una ricerca tra i file di una cartella ed eseguire quindi la sostituzione in un colpo solo per tutti i file.
Hai anche varie opzioni di ricerca, come ad esempio l'uso di espressioni regolari. A questo punto direi che hai tutti gli strumenti per risolvere senza dover necessariamente ricorrere ad uno script.
Può essere una valida alternativa per la tua esigenza?